动物科学学院拥有华南农业大学最早设立的学科——畜牧学、蚕桑学。1952年由中山大学、岭南大学、广西大学农学院畜牧兽医系组建成华南农学院畜牧兽医系，设畜牧专业。1987年成立畜牧系，1992年更名为动物科学系，2001年成立动物科学学院，2003年蚕学并入动物科学学院。长期以来，学院与以广东温氏食品集团为代表的一大批优秀企业开展广泛深入合作，凝练出产学研结合的鲜明的办学特色，合作成果先后获得国家教学成果二等奖和国家科技进步二等奖，成为国内产学研合作的典范。